這是受到來自于天空的飛龍襲擊,人類暴露在威脅之中的現代。 人類驅使以魔術所創造出來的蛇之靈體《利維坦》,每日持續不斷地進行抗戰。身為‘蛇'之契約者,討伐龍的救世之戰乙女——《魔女》。從事于與她們訂下契約的工作為生的少年春賀晴臣受到其青梅竹馬,作為歐洲屈指可數的魔女愛莎的邀請（被強行地）而久違地再次回到‘東京新都',與有著如妖精般的容貌的少女一起生活,并在轉學到的高校為確保據點而四處奔波,但突然卻遭遇到了上位種之龍‘蘇斯'的襲擊——！？