《NOiSE》的時代背景在《BLAME！》數千年以前,兩部作品的世界觀幾乎相同。一個神秘教團利用網絡混沌所產生的力量,以人類作為基礎,制造出現代武器根本完全無法加以傷害的類似安全警衛的怪物,根據網絡蘇菲亞所說,有人偷了統治局的核心技術,估計就是指那個教團。后來這個教團全體成員利用網絡混沌變成了“另一種生物”,他們與《BLAME！》里的硅素生物有著千絲萬縷的聯系。神秘的少女結的出現,成為了對抗他們的「暗殺者」！